Anaconda介绍
Anaconda（官方网站）就是可以便捷获取包且对包能够进行管理，同时对环境可以统一管理的发行版本。Anaconda包含了conda、Python在内的超过180个科学包及其依赖项。
套件管理
显示已安装的套件
套件安装
conda install packages # pip可以安装一些conda安装不了的包
pip install packages [-i https://pypi.douban.com/simple] # -i部分临时指定pip源
easy_install 参数 packages
python setup.py install # 下载源码，进入到源码路径下
国内的pip源
阿里云 https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/
中国科技大学 https://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/
豆瓣(douban) https://pypi.douban.com/simple/
清华大学 https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/
pip install xx -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host=pypi.douban.com/simple
从Anaconda.org安装套件
# 如果一个包不能使用conda安装，可在Anaconda.org查找
# 在左上角的叫“Search Anaconda Cloud”搜索框中输入“包名”并点击search按钮
conda install --channel https://conda.anaconda.ort/pandas bottleneck # 安装bottleneck包
删除套件
conda/pip uninstall packages
easy_install -m packages
查找套件
pip管理
升级
# 试用linux, win下可能会因为权限升级失败
pip install --upgrade pip
# win或linux
python -m pip install --upgrade pip
如果不小心删掉了pip，可以用以下命令安装
python -m ensurepip --default-pip
安装
基础准备(centos7环境)
安装wget命令：yum -y install wget
安装git相关
# 安装git
yum install git -y
# 安装git lfs（大文件下载）
curl -s https://packagecloud.io/install/repositories/github/git-lfs/script.rpm.sh | sudo bash
yum install git-lfs
git lfs install
安装OpenSSL和libssl-dev
yum install openssl
yum install openssl-devel
安装步骤
# 安装anaconda环境
wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2023.07-2-Linux-x86_64.sh
chmod +x Anaconda3-2023.07-2-Linux-x86_64.sh
./Anaconda3-2023.07-2-Linux-x86_64.sh
# 创建自己的python环境
conda create -n gpt310 python=3.10 anaconda
虚拟环境管理
使用Anaconda Prompt 管理虚拟环境
新建虚拟环境
添加后缀 “anaconda”或“biopython”可以创建一个基本科学计算功能完备的环境
conda create -n 环境名 python=3.7 anaconda
切换虚拟环境
source activate snowflakes # Linux，OS X
activate snowflakes # Windows
关闭虚拟环境
source deactivate # Linux，OS X
deactivate # Windows
查看所有的虚拟环境名称
conda info -e
conda env list
移除虚拟环境
conda remove -n 虚拟环境名称 --all
复制虚拟环境
conda create -n 虚拟环境名称 --clone root
IPython 交谈式命令窗口
更新conda本身
更新anaconda 应用
更新python
假设当前python环境是3.6.1，而最新版本是3.6.2，那么就会升级到3.6.2
conda源管理
查看当前源信息
关注 channel URLs 字段内容
添加一个镜像
# 添加镜像
(base) C:\Users\hyc>conda config --add channels 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/'
# 设置搜索时显示channel地址
(base) C:\Users\hyc>conda config --set show_channel_urls yes
删除一个镜像
# 注意链接要有引号，英文输入法
(base) C:\Users\hyc>conda config --remove channels 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/'
查看conda的镜像
conda config --show-sources
conda config --show channels
删除所有镜像
conda config --remove-key channels
以上操作可以直接编辑.condarc文件完成
ssl_verify: False
proxy_servers:
http: http://192.168.4.80:3128
https: http://192.168.4.80:3128
channels:
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
- defaults
show_channel_urls: True
其他管理
运行环境分享
执行如下命令可以将当前环境下的 package 信息存入名为 environment 的 YAML 文件中
conda env export > environment.yaml
使用yaml文件创建环境
conda env create -f environment.yaml
国内常见源
linux可行
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
